Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb1P04202 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms