Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01878 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01878 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01878 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01878 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01878 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms