Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TcraP01849 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TcraP01849 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TcraP01849 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TcraP01849 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TcraP01849 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TcraP01849 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TcraP01849 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TcraP01849 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TcraP01849 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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