Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01666 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01666 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01666 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01666 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01666 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01666 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01666 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01666 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms