Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01665 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01665 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01665 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01665 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01665 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01665 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01665 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01665 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms