Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01664 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01664 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01664 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01664 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms