Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P01649 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P01649 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P01649 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms