Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01636 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01636 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01636 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01636 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01636 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms