Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CopeO89079 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopeO89079 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms