Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms