Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BlmO88700 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BlmO88700 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BlmO88700 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BlmO88700 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BlmO88700 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BlmO88700 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BlmO88700 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BlmO88700 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BlmO88700 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BlmO88700 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BlmO88700 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms