Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClppO88696 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClppO88696 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClppO88696 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClppO88696 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClppO88696 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms