Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms