Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms