Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms