Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms