Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms