Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms