Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb2O55029 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms