Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LatO54957 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LatO54957 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LatO54957 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LatO54957 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LatO54957 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LatO54957 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LatO54957 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LatO54957 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LatO54957 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LatO54957 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LatO54957 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms