Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TsksO54887 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TsksO54887 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TsksO54887 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TsksO54887 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TsksO54887 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TsksO54887 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TsksO54887 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TsksO54887 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TsksO54887 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TsksO54887 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TsksO54887 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TsksO54887 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TsksO54887 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TsksO54887 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TsksO54887 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms