Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpd52l1O54818 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms