Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChkaO54804 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChkaO54804 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ChkaO54804 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkaO54804 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms