Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limk2O54785 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limk2O54785 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms