Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Psmb10O35955 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Psmb10O35955 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Psmb10O35955 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psmb10O35955 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Psmb10O35955 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psmb10O35955 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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