Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FxnO35943 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FxnO35943 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms