Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms