Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag2O35638 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms