Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a2O35488 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a2O35488 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms