Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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