Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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