Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kpna6O35345 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms