Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms