Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad6O35182 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms