Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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