Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms