Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr1aO35134 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1aO35134 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms