Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc23O35125 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms