Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArxO35085 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArxO35085 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ArxO35085 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms