Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sema3aO08665 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms