Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MttpO08601 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MttpO08601 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MttpO08601 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MttpO08601 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MttpO08601 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MttpO08601 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MttpO08601 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms