Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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