Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2888K7N746 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms