Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms