Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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