Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd4b4J3QNS5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms