Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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