Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21976J3QNN2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21976J3QNN2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21976J3QNN2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21976J3QNN2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms