Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21897J3KMP5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms