Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm20828J3KMI7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm20828J3KMI7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm20828J3KMI7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20828J3KMI7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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